利用Illumina或華大測序平臺對某一物種的個體或群體進行全基因組測序，并進行生物信息學分析，獲得SNP/CNVs/InDel/SV等遺傳變異信息。
轉錄組測序是一種對機體組織、細胞轉錄本進行定量和定性分析的技術，主要用于基因表達分析，也可以用于新轉錄本、SNP、剪接變體鑒定，等位基因差異表達分析等。該技術已在臨床診斷、基礎研究和藥物開發等領域廣泛應用。
全外顯子組測序（WES）是指對基因組蛋白編碼區進行特性捕獲測序，鑒定蛋白編碼區域遺傳變異的方法，主要應用于人類癌癥、孟德爾遺傳疾病診斷等。
捕獲測序是指對基因組特定區域進行特異性的高深度測序，包括QTL區域、蛋白編碼區域、基因調控區域等，影子基因擁有自主的精準捕獲測序技術，能夠對10Kb-2Mb任意大小基因組片段進行捕獲測序。
利用高通量測序技術分析環境樣品所包含的全部微生物的群體基因組成及功能，解讀微生物群體的多樣性、豐度、種群結構、進化關系，微生物與環境，微生物與宿主之間關系的微生物研究方法。
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