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產品服務

一、產品簡介

染色質免疫共沉淀（Chromatin Immunoprecipitation，ChIP）是研究蛋白質與DNA相互作用的經典技術，普遍應用于基因組轉錄因子結合特征、組蛋白修飾特征等研究。該技術與二代測序相結合形成了ChIP-seq技術，后者廣泛應用于動物、植物和人類功能基因組研究，揭示特定蛋白與基因組DNA互作關系，解析基因表達調控規律。

二、服務流程

1. 適用多種組織、細胞樣品：新鮮、冰凍組織均可，各種細胞均可。

2. 樣品低起始量：組織樣品最低為1g/樣，細胞最低為5×107個 /樣。

3. 數據質量高：FRiP、TSS富集分析等質控結果達到ENCODE計劃標準。

2020年11月，美國西北大學Hongbo Yang等在《Nature》雜志發表斑馬魚基因組調控元件研究結果。研究通過H3K4me3、H3K27ac兩個因子ChIP-seq數據鑒定出斑馬魚基因組啟動子和增強子元件；通過H3K9me3、H3K9me2兩個因子ChIP-seq數據鑒定出斑馬魚基因組異染色質區域。另外，研究還通過多組學整合分析，對斑馬魚基因組進行了全面注釋。

圖3.斑馬魚全基因組調控元件鑒定

文獻： A map of cis-regulatory elements and 3D genome structures in zebrafish, 2020, Nature

2020年2月，華中農業大學Zhou等在《Cell death & Disease》雜志發表miRNA調控成肌細胞增殖分化研究結果。研究通過整合miRNA測序、轉錄因子ChIP-seq及ATAC-seq等數據，解析了miRNA在成肌細胞增殖分化過程中的表達調控規律。結果發現在成肌細胞分化過程中，miRNA表達受染色質開放狀態調控。

上圖：整合多組學數據解析成肌細胞增殖分化過程中miRNA表達調控分子機理

文獻： Chromatin accessibility is associated with the changed expression of miRNAs that target members of the Hippo pathway during myoblast differentiation, 2020, Cell death & disease

1. 樣品類型及樣品量

新鮮組織、凍存組織、新鮮細胞、凍存細胞與IP富集DNA樣品都可以；其它類型樣品請詳詢。

細胞樣品最低 5×107個/樣；組織樣品最低1g/樣；IP富集DNA樣品最低10ng/樣。

2. 采樣注意事項

（1）重復性控制：采樣要盡量保證時間、部位、性別、年齡等條件一致。

（2）避免交叉污染：采樣過程中盡量避免樣品間相互污染。

3. 樣品保存

（1）組織樣品：動物處死后30分鐘內，完成組織采集，組織簡單剪碎后裝入2ml凍存管，液氮速凍，速凍至少2小時，然后轉入-80℃冰箱保存。采樣盡量保持低溫，操作要迅速，避免樣品降解（具體細節請詳詢）。

（2）細胞樣品：1%甲醛固定（具體細節請詳詢）。